Простийпошук |
Розширенийпошук |
Покажчики
|
Професійний пошук |
Рубрикатор НБУВ |
Розподілений пошук |
Бази даних
Наукова періодика України - результати пошуку
Книжкові видання та компакт-дискиЖурнали та продовжувані виданняАвтореферати дисертаційРеферативна база данихНаукова періодика УкраїниТематичний навігаторАвторитетний файл імен осіб
 |
Для швидкої роботи та реалізації всіх функціональних можливостей пошукової системи використовуйте браузер "Mozilla Firefox" |
|
|
Повнотекстовий пошук
| Знайдено в інших БД: | Книжкові видання та компакт-диски (4) | Журнали та продовжувані видання (3) | Реферативна база даних (13) | Авторитетний файл імен осіб (1) |
Список видань за алфавітом назв: Авторський покажчик Покажчик назв публікацій  |
Пошуковий запит: (<.>A=Щербатенко І$<.>) | |||
|
Загальна кількість знайдених документів : 15 Представлено документи з 1 до 15 |
|||
| 1. | 
Щербатенко І. В. Виділення ключових принципів методики оцінки інвестиційної привабливості на основі аналізу існуючих методик [Електронний ресурс] / І. В. Щербатенко // Економічний простір. - 2013. - № 71. - С. 144-152. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/ecpros_2013_71_17 | ||
| 2. | 
Кириченко А. М. Вибірковість кодонів і заміни нуклеотидів у генах вірусу карликовості сої [Електронний ресурс] / А. М. Кириченко, О. І. Гордейчик, І. С. Щербатенко // Мікробіологічний журнал. - 2012. - Т. 74, № 3. - С. 90-97. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/MicroBiol_2012_74_3_15 Проведено комп'ютерний аналіз вибірковості кодонів і спонтанних замін нуклеотидів у шести штамів вірусу карликовості сої. Встановлено, що частота використання синонімічних кодонів у вірусних генах широко варіює залежно від гена, перекривання генів, кодона, послідовності перших двох кодонних нуклеотидів, однонуклеотидних контекстів, локалізованих перед кодоном і за ним, а також від вмісту GC (G+C) у генах і в третій позиції кодонів. Під впливом перекривання генів загальна кількість нуклеотидних замін зменшується в 2,5 разів, кількість еквівалентних замін у третій позиції кодонів - у 2,8 - 4,3 рази, вміст дикодонів у генах - у 1,4 - 1,6 разів. Поряд із цим спостерігається збільшення кількості нееквівалентних замін нуклеотидів у другій кодонній позиції, а також висока вибірковість кодонів (Fop = 0,94 - 1,0) і кореляція між вмістом нуклеотидів у генах і третіх позиціях кодонів (r = 0,73 - 0,74). Одержані результати свідчать про наявність селекції дикодонів у вірусних генах. | ||
| 3. |
Підгорський В. С. Рецензія на монографію Л. Т. Міщенко "Вірусні хвороби озимої пшениці". - Київ: Фітосоціоцентр, 2009. – 352 с. [Електронний ресурс] / В. С. Підгорський, І. С. Щербатенко // Мікробіологічний журнал. - 2011. - Т. 73, № 1. - С. 56-58. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/MicroBiol_2011_73_1_10 | ||
| 4. |
Кириченко А. М. Спонтанні заміни нуклеотидів у генах Х-вірусу картоплі [Електронний ресурс] / А. М. Кириченко, І. С. Щербатенко // Мікробіологічний журнал. - 2012. - Т. 74, № 6. - С. 71-79. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/MicroBiol_2012_74_6_12 З'ясування факторів, що визначають типи і темпи замін нуклеотидів у геномах, має важливе значення для вдосконалення розповсюджених моделей молекулярної еволюції, дослідження еволюційного процесу, розпізнавання кодуючих і некодуючих РНК, ідентифікації біологічно важливих мотивів, а саме: реплікаційних сигналів, регуляторних ділянок тощо. Однак, багато питань стосовно факторів, що впливають на заміни нуклеотидів у геномах вірусів рослин, все ще залишаються не з'ясованими. Проведено порівняльний комп'ютерний аналіз замін нуклеотидів у геномних сиквенсах десяти пар близько споріднених штамів Х-вірусу картоплі з однаковою довжиною геномів і генів. Виявлено значне варіювання частоти замін залежно від пар нуклеотидів і штамів, довжини та локалізації ділянок геномів і генів, а також типу замін та їх кодонних позицій. Найбільші відношення частот замін знайдено в різних парах нуклеотидів (<$Eu~symbol О~c "/" c~symbol О~g>, 1240), кодонних позиціях (третя/друга, 17,3) та типах (транзиції/трансверсії, 5,8); найменші - у прямих і зворотних замін нуклеотидів однієї пари (1,03 - 1,6). Частота трансверсій набагато менша, але значно більш варіабельна, ніж транзицій, і не має чіткої залежності від довжини гена (нуклеотидної ділянки). | ||
| 5. |
Гордейчик О. І. Контексти стартових кодонів трансляції генів тобамо- і потексвірусів [Електронний ресурс] / О. І. Гордейчик, І. С. Щербатенко // Мікробіологічний журнал. - 2010. - Т. 72, № 1. - С. 39-46. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/MicroBiol_2010_72_1_8 Проведено комп'ютерний аналіз контекстів (нуклеотидного оточення) канонічного стартового кодона трансляції AUG у 15 тобамовірусів (45 генів) і 22 потексвірусів (110 генів). Встановлено, що контексти AUG вірусів рослин мають як високу схожість із відповідними контекстами еукаріотів, так і деякі особливості. Схожість проявляється в локалізації збіжних нуклеотидів поблизу стартового кодона (в позиціях -3... +18), наявності пурина в позиції -3 (-3R) і гуаніна в позиції +4 (+4G) відносно кодона AUG, а також у подібності трансляційних контекстів вірусів відповідним контекстам хребетних тварин (16,9 - 52,4 %) та однодольних (21,9 - 41,2 %) і дводольних рослин (39,3 - 74,3 %). Характерною особливістю вірусних трансляційних контекстів є висока частота компонентів +5С, -5Y і +10R, а також широке варіювання частоти контекстних елементів у різних вірусів і/або генів. Обговорено запропонований показник подібності трансляційних контекстів відомим консенсусним послідовностям. | ||
| 6. |
Гордейчик О. І. Контексти супресивних термінальних кодонів трансляції генів РНК‑вмісних вірусів рослин [Електронний ресурс] / О. І. Гордейчик, І. С. Щербатенко // Мікробіологічний журнал. - 2010. - Т. 72, № 6. - С. 58-65. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/MicroBiol_2010_72_6_11 Проведено комп'ютерний пошук в генетичних банках даних супресивних термінальних кодонів трансляції (СТКТ) генів вірусів рослин та порівняльний аналіз контекстів супресії цих кодонів. Встановлено, що в геномах вірусів рослин найчастіше супресуються стоп-кодони UAG (167 із 211, 79,1 %), рідше - UGA (37/211, 17,5 %) і зовсім рідко - UAA (7/211, 3,3 %). Більшість слабких (супресивних) термінальних кодонів у відносній позиції +4 містять гексануклеотидні сайти caauua, cgguuu, gggugc, ggaggc або guagac, які вважаються важливими (консенсусними) елементами контекстів СТКТ РНК-вмісних вірусів рослин, тварин і мікроорганізмів. Поряд із цим у генах багатьох вірусів спостерігається широка мінливість послідовностей консенсусних гексануклеотидних сайтів, а також додаткові позиції їх локалізації в різних рамках зчитування і на різних відстанях від термінальних кодонів. Характерною рисою супресивних термінальних кодонів трансляції є наявність кластерів збіжних нуклеотидних сайтів у різних родів вірусів на ділянках довжиною до кількох сотень нуклеотидів від цих кодонів. Результати проведених досліджень підтримують припущення про те, що ефективність трансляції, а також прочитування стоп-кодонів можуть бути детерміновані на рівні геномів чи генів, а не лише короткими контекстами, що оточують термінальні кодони. | ||
| 7. |
Гордєйчик О. І. Пошук подібних нуклеотидних сайтів у геномних сиквенсах фітопатогенних вірусів [Електронний ресурс] / О. І. Гордєйчик, І. С. Щербатенко // Мікробіологічний журнал. - 2009. - Т. 71, № 4. - С. 63-70. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/MicroBiol_2009_71_4_12 | ||
| 8. | 
Щербатенко І. Аналіз факторів, що впливають на інвестиційну привабливість підприємств авіатранспортної галузі [Електронний ресурс] / І. Щербатенко, О. Горбачова // Економічний аналіз. - 2013. - Т. 12(4). - С. 166-170. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/ecan_2013_12(4)__38 | ||
| 9. | 
Щербатенко І. В. Основні причини недосконалості діючої системи оподаткування в Україні [Електронний ресурс] / І. В. Щербатенко, Л. А. Слюсар // Формування ринкових відносин в Україні. - 2015. - № 4. - С. 48-51. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/frvu_2015_4_14 | ||
| 10. | 
Щербатенко І. В. Вплив податків на інвестиційну діяльність [Електронний ресурс] / І. В. Щербатенко, В. А. Рябошапка // Інвестиції: практика та досвід. - 2015. - № 1. - С. 95-98. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/ipd_2015_1_22 | ||
| 11. |
Щербатенко І. В. Основні причини недосконалості діючої системи оподаткування в Україні [Електронний ресурс] / І. В. Щербатенко, Л. А. Слюсар // Формування ринкових відносин в Україні. - 2015. - № 2. - С. 38-41. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/frvu_2015_2_11 | ||
| 12. |
Кириченко А. М. Консервативні нуклеотидні мотиви та вторинні структури в промоторах субгеномних РНК тобамовірусів [Електронний ресурс] / А. М. Кириченко, І. С. Щербатенко // Мікробіологічний журнал. - 2019. - Т. 81, № 1. - С. 106-123. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/MicroBiol_2019_81_1_11 Зважаючи на фрагментарність експериментальних даних і суперечливість уявлень щодо ролі первинних і вторинних структур РНК у активності субгеномих (сг) промоторів, метою роботи було виявлення і порівняння властивостей консервативних нуклеотидних мотивів і стеблових петель у сг промоторах двох генів 38-ми тобамовірусів. Геноми і сиквенси 17-ти штамів ВТМ та 21 штаму інших видів тобамовірусів було завантажено з Ген Банку (http://www.ncbi. nlm.nih.gov/). Пошук і порівняльний аналіз консервативних компонентів промоторів проводили за одержаними одноланцюговими розгортками 3-х стеблових петель і консенсусною послідовністю мотивів трьохкомпонентного нуклеотидного блоку (ТНБ), використовуючи вузькоспеціалізовані комп'ютерні програми. Встановлено, що всі 76 досліджених сг промоторів 2-х генів 38-ми тобамовірусів містять консервативні ТНБ, які виявляються в сиквенсах мінус-ланцюгів геномних РНК за консенсусною послідовністю SSSSSnnnnnCYAAGCWWWnnWWWWW, де SSSSS - GC-багатий мотив, nnnnn та nn-довільні (не консенсусні) нуклеотиди, CYAAGCWWW-центральний мотив, WWWWW - AU-багатий мотив, Y-нуклеотид C або U. Ідентичність консенсусній послідовності мотивів ТНБ штамів ВТМ становить 99,5 %, а мотивів ТНБ інших видів тобамовірусів - 88,3 %. Ідентичність нуклеотидів стеблових петель SL1, SL2 та SLcp відповідним петлям штаму BTM-U1 складає 74,4, 75,7 та 60,3 % відповідно. Всі 75 із 76-ти досліджених ТНБ у шостій позиції центрального мотиву містять нуклеотид C, геномні позиції якого відповідають стартовим точкам транскрипції (СТТ) сг РНК. СТТ обох генів всіх досліджених тобамовірусів локалізовані перед стартовими кодонами трансляції за винятком гена транспортного білка Вірусу кільцевої плямистості одонтоглосума. Досліджені авторами тобамовіруси чітко розподіляються на 4 групи за подібністю консервативних мотивів і замін нуклеотидів у субгеномних промоторах. Висновки: результати проведених досліджень суперечать припущенню щодо більш важливої ролі вторинних структур, а не первинних нуклеотидних послідовностей у функціональній активності сг промоторів тобамовірусів. Показана локалізація AU-багатих мотивів після стартових кодонів транскрипції сг РНК свідчить про можливість синтезу тобамовірусних РНК на двохланцюгових матрицях. Знайдені авторами групи штамів різних видів тобамовірусів з ідентичними нуклеотидними ділянками та однаковими замінами нуклеотидів доповнюють обмежений на сьогодні перелік прояву гомологічних рядів М. І. Вавилова на молекулярному рівні, а також узгоджуються з припущенням авторів щодо молекулярних механізмів утворення гомологічних рядів - можливістю фіксації лише тих нуклеотидних замін, які не порушують тонко збалансованого функціонування кількох генетичних кодів в одній клітині. | ||
| 13. |
Кириченко А. М. Консервативні нуклеотидні мотиви в промоторах геномник РНК тобамовірусів [Електронний ресурс] / А. М. Кириченко, І. С. Щербатенко // Мікробіологічний журнал. - 2019. - Т. 81, № 3. - С. 53-67. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/MicroBiol_2019_81_3_6 Реплікація тобамовірусів, як і інших вірусів рослин, що мають одноланцюгову смислову геномну РНК, включає синтез позитивних і негативних ланцюгів геномних РНК, а також транскрипцію двох субгеномних РНК. Первинні нуклеотидні послідовності та вторинні структурні елементи, необхідні для ініціації транскрипції субгеномних РНК, охарактеризовано у багатьох видів вірусів, однак, компоненти промоторів синтезу геномних вірусних РНК все ще залишаються майже недослідженими. Зважаючи на фрагментарність експериментальних даних і суперечливість уявлень щодо ініціації синтезу геномних вірусних РНК, мета роботи - проведення порівняльного комп'ютерного аналізу консервативних компонентів у геномних промоторах тобамовірусів. Геномні сиквенси 17-ти штамів ВТМ і 21 штаму 18-ти інших видів тобамовірусів були завантажені з ГенБанку. Пошук і порівняльний аналіз консервативних компонентів промоторів проведено за консенсусною послідовністю ділянки ICR2 промотору генів tRNA та одноланцюговою розгорткою стеблової петлі D1L3S3 штаму ВТМ-L, використовуючи власні вузькоспеціалізовані комп'ютерні програми. Встановлено, що 3'-кінцеві ділянки геномних РНК 38-ми досліджених штамів тобамовірусів містять висококонсервативні нуклеотидні мотиви, подібні ICR2 і D1L3S3. У промоторах реплікації геномних (-)РНК ці мотиви локалізовані перед і поблизу стартових точок синтезу (-)ланцюгів, містять загальну паліндромну консенсусну послідовність - TTCGAA, оточену 2 - 4 парами комплементарних нуклеотидів і мають лише компенсаторні нуклеотидні заміни, за яких зберігається вторинна структура консервативних мотивів. Поблизу стартових точок синтезу (+)ланцюгів РНК, локалізованих на 3'-кінцях (-)ланцюгів, нуклеотидні ділянки, подібні ICR2 чи D1L3S3, а також інші консервативні мотиви зовсім не виявляються. За результатами аналізу можливих причин цього явища запропоновано гіпотетичні моделі ініціації синтезу геномних і субгеномних РНК тобамовірусів із використанням дволанцюгових і циркулярних матриць. Встановлено, що запропоновані гіпотетичні моделі добре узгоджуються з отриманими результатами і даними літератури, зокрема: наявність подібних консервативних мотивів і вторинних структур у різних типах промоторів - субгеномних, геномних, вірусних, еукаріотичних; здатність вірусних РНК-полімераз до використання дволанцюгових і циркулярних матриць; можливість ініціації синтезу протилежних ланцюгів РНК одним паліндромним сигнальним мотивом; локалізація AT-багатих нуклеотидних ділянок після стартових точок транскрипції та реплікації РНК, а GC-багатих ділянок - перед ними; підвищення реплікації вірусів за зв'язування 5'- і 3'-кінців геномних РНК. | ||
| 14. |
Кириченко А. М. Бур’яни – резерватори вірусів в агробіоценозах зернобобових в Україні [Електронний ресурс] / А. М. Кириченко, М. М. Богдан, І. С. Щербатенко // Мікробіологічний журнал. - 2020. - Т. 82, № 6. - С. 94-106. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/MicroBiol_2020_82_6_11 | ||
| 15. | 
Кириченко А. М. Віруси дикої флори та сучасні метагеномні методи їх дослідження [Електронний ресурс] / А. М. Кириченко, І. С. Щербатенко, О. Г. Коваленко // Цитологія і генетика. - 2021. - Т. 55, № 3. - С. 48-57. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/CLG_2021_55_3_7 | ||
Попередній перегляд: 
Реферативна БД
 |
| Відділ наукової організації електронних інформаційних ресурсів |
 Пам`ятка користувача |